Τον έλεγχο όλων των επιχειρήσεων που έλαβαν επιδοτήσεις από το Δημόσιο διέταξαν οι οικονομικοί εισαγγελείς, οι οποίοι ζήτησαν από το υπουργείο Ανάπτυξης πλήρη κατάλογο με τις επωνυμίες, τα ποσά και την περίοδο εκταμίευσης των εγκεκριμένων κονδυλίων.

Οι Γρ. Πεπόνης και Σπύρος Μουζακίτης έδωσαν εντολή στις 13 περιφερειακές διευθύνσεις του ΣΔΟΕ να ερευνήσουν αν οι εταιρείες αυτές, που χρηματοδοτούνται από το 2004 και μετά, υλοποίησαν τα επενδυτικά προγράμματα για τα οποία επιδοτήθηκαν. Για τον λόγο αυτόν απέστειλαν ήδη καταλόγους με τα στοιχεία των εταιρειών, ζητώντας να ξεκινήσουν οι έλεγχοι από αυτές που εισέπραξαν τα υψηλότερα χρηματικά ποσά και όπου διαπιστώνονται παραβάσεις θα σχηματίζονται αυτοτελείς δικογραφίες και οι υπεύθυνοι θα παραπέμπονται να λογοδοτούν στη Δικαιοσύνη.