Αλλαγές όμως και στα φορολογικά προβλέπουν διατάξεις που περιλαμβάνονται στο νομοσχέδιο που ψηφίστηκε στη Βουλή. Συγκεκριμένα στις αλλαγές περιλαμβάνονται:
n Με κοινές αποφάσεις του υπουργού Οικονομικών και του υπουργού Εργασίας και Κοινωνικής Ασφάλισης, ορίζεται ο τύπος και το περιεχόμενο της προσωρινής δήλωσης Φόρου Μισθωτών Υπηρεσιών η οποία, εκτός από τα ακαθάριστα ποσά, τον φόρο και το ποσό της ειδικής εισφοράς αλληλεγγύης που παρακρατήθηκε τον προηγούμενο μήνα, μπορεί να περιλαμβάνει και τις οφειλόμενες εισφορές κοινωνικής ασφάλισης.
n Ιδιωτικά έγγραφα μίσθωσης αστικών ακινήτων, ασχέτως ποσού μισθώματος ή γεωργικών ακινήτων, εφόσον το μίσθωμα είναι πάνω από 100 ευρώ κάθε μήνα υποβάλλονται ηλεκτρονικά από τον εκμισθωτή ή τον μισθωτή μέσα στον επόμενο μήνα από τη σύνταξή τους.
n Μεταβιβάζονται και οι φόροι. Αν μεταβιβαστεί η κυριότητα ακινήτου, ο νέος κύριος είναι αλληλεγγύως και εις ολόκληρον συνυπεύθυνος με τον προκάτοχο για την πληρωμή του φόρου των τριών ετών πριν από τη μεταβίβαση που αναλογεί επιμεριστικά στο εισόδημα του ακινήτου που μεταβιβάστηκε και προκύπτει από την εγγραφή που υπάρχει κατά την ημέρα της μεταβίβασης. Οι συμβολαιογράφοι έχουν την υποχρέωση να υπενθυμίζουν τη συγκεκριμένη διάταξη.
n Από το 2012 και μετά το Ε9 υποβάλλεται ατομικά από κάθε φυσικό πρόσωπο, στο έτος που προκύπτει τέτοια υποχρέωση. Για τα προστατευόμενα τέκνα η δήλωση στοιχείων ακινήτων υποβάλλεται από τον υπόχρεο γονέα στο όνομα του τέκνου.
n Δεν εκπίπτει το χαράτσι. Το έκτακτο ειδικό τέλος ηλεκτροδοτούμενων δομημένων επιφανειών δεν αναγνωρίζεται ως δαπάνη από τα ακαθάριστα έσοδα των επιχειρήσεων.
n Το ύψος του εισοδήματος λόγω αντικειμενικών δαπανών διαβίωσης ή αυτό που προέρχεται αποκλειστικά από μισθούς και λαμβάνεται υπόψη ως προς την υποχρέωση υποβολής δήλωσης φόρου εισοδήματος, γίνεται νομοτεχνική προσαρμογή ώστε να συμβαδίζει με το αφορολόγητο ποσό της κλίμακας φόρου εισοδήματος φυσικών προσώπων (5.000 ευρώ).
n Φόρος στις πωλήσεις μετοχών. Δεν αλλάζει τίποτα μέχρι τις 31 Δεκεμβρίου 2012 όσον αφορά τον τρόπο φορολόγησης των κερδών μετοχών εισηγμένων στο ΧΑ καθώς θα συνεχίσει να επιβάλλεται φόρος συναλλαγών 2 τοις χιλίοις κατά την πώληση. Αντίθετα, κατά την πώληση μετοχών οι οποίες αποκτώνται από την 1η Ιανουαρίου 2013 και μετά, το κέρδος θα φορολογείται με βάση την κλίμακα φορολογίας εισοδήματος επομένως – με τα σημερινά δεδομένα – με συντελεστές που φτάνουν έως και το 45%.