Το Αντιρατσιστικό προκάλεσε αρκετά εσωτερικά προβλήματα στη Δημοκρατική Αριστερά. Ο βουλευτής Αθηνών Γιάννης Πανούσης με δηλώσεις του ανέφερε ότι «χρειάζεται προσοχή με το Αντιρατσιστικό για να μη μας γυρίσει ανάποδα», σχολιάζοντας μάλιστα στον Βήμα FM ότι «ανοίγουμε μια πόρτα που θέλει πολλή συζήτηση όχι για τις πράξεις αλλά για τον ορισμό π.χ. της γενοκτονίας ή των εγκλημάτων πολέμου, το οποίο φέρνει προβλήματα».
Οι δηλώσεις Πανούση δεν πήραν μεγάλη έκταση καθώς τις επόμενες ώρες ο ίδιος ο βουλευτής προσπάθησε με νεότερες δηλώσεις του να λειτουργήσει πυροσβεστικά κάνοντας τις απαραίτητες διορθώσεις. Ομως έξυσε παλιές πληγές στο εσωτερικό της Δημοκρατικής Αριστεράς που συνδέονται με τη συνολική συμπεριφορά του Γιάννη Πανούση ως βουλευτή. Μόλις τον περασμένο Μάρτιο ο πανεπιστημιακός, πρώην πρύτανης του Δημοκριτείου, οδηγήθηκε σε μετωπική με τον Φώτη Κουβέλη για το σχέδιο «Αθηνά» του υπουργείου Παιδείας ζητώντας την καταψήφισή του, την ώρα που η Αγίου Κωνσταντίνου δεν είχε καταλήξει σ’ αυτήν τη γραμμή. Την κατάσταση έσωσε το γεγονός ότι τελικώς η ΔΗΜΑΡ επέλεξε το «όχι» διαπιστώνοντας ότι η υπερψήφισή του θα δημιουργούσε σοβαρές εσωτερικές αναταράξεις.
Ο βουλευτής της Α’ Αθήνας έγινε ωστόσο δέκτης οξύτατης κριτικής από την Εκτελεστική Επιτροπή της ΔΗΜΑΡ και τον περασμένο Νοέμβριο, όταν στην ψηφοφορία για τον προϋπολογισμό αντί να παραμείνει και να ψηφίσει «ναι», όπως είχε αποφασίσει το κόμμα, αποχώρησε χωρίς να ειδοποιήσει κανέναν και καταγράφηκε ως απών. Η ψηφοφορία είχε ιδιαίτερη σημασία για τη Δημοκρατική Αριστερά και τον Φώτη Κουβέλη καθώς το κόμμα είχε επιλέξει το «παρών» στην ψηφοφορία για το Μνημόνιο λόγω των εργασιακών και ήθελε να δείξει συνέπεια στην ψήφιση του προϋπολογισμού. Υπήρξε και μια δεύτερη φορά που ο κ. Πανούσης… εξαφανίστηκε από ψηφοφορία κι αυτό ήταν κατά την ψήφιση του Φορολογικού, όπου επίσης καταγράφηκε ως «αδικαιολογήτως» απών.
Το τελευταίο διάστημα παραλίγο να προκληθεί και μια εσωκομματική παρεξήγηση όταν ο διαγραφείς Οδυσσέας Βουδούρης συμπεριέλαβε το όνομα του βουλευτή Γ. Πανούση σε εκδήλωση νέας πολιτικής κίνησης.