Από τη δεξαμενή των ανεξάρτητων βουλευτών, που αριθμούν τους εννέα, η κυβέρνηση έχει να προσδοκά με βεβαιότητα μόνο τη στήριξη της υφυπουργού Προστασίας του Πολίτη Κατερίνας Παπακώστα, η οποία από κυβερνητικά στελέχη προσμετράται στα «υπέρ» της συμφωνίας των Πρεσπών, παρότι η ίδια δηλώνει ότι αναμένει να δει το τελικό κείμενο. Αγνωστο παραμένει τι θα πράξει ο Νίκος Νικολόπουλος σε περίπτωση που τεθεί θέμα εμπιστοσύνης προς την κυβέρνηση, αν και έχει ταχθεί κατά της συμφωνίας των Πρεσπών, ενώ χαμένος για την κυβέρνηση θεωρείται ο πρώην βουλευτής του ΣΥΡΙΖΑ Στάθης Παναγούλης, ο οποίος έχει προσεγγίσει το Κίνημα Αλλαγής και δεν προτίθεται να στηρίξει ούτε τη συμφωνία ούτε την κυβέρνηση Τσίπρα.
Κατά της συμφωνίας αναμένεται να ταχθεί και ο Αριστείδης Φωκάς που είχε αποχωρήσει από την Ενωση Κεντρώων, ενώ δεδομένη είναι και η αρνητική στάση των Δημήτρη Καμμένου και Γιώργου Λαζαρίδη που είχαν αποχωρήσει από τους ΑΝΕΛ, διαφωνώντας με τους χειρισμούς του Πάνου Καμμένου που δεν απέτρεψε την υπογραφή της συμφωνίας. Οσον αφορά τους εναπομείναντες τρεις ανεξάρτητους που προέρχονται από τη Χρυσή Αυγή – Κ. Μπαρμπαρούση, Δ. Κουκούτση και Ν. Μίχο -, αναμένεται να καταψηφίσουν τη συμφωνία.
