Θέμα της ελληνικής κυβέρνησης και μόνο αποτελεί ο τρόπος της επιλογής των μουφτήδων στη Θράκη, απαντούν κυβερνητικοί αξιωματούχοι όταν ερωτώνται για την κριτική που μέρος της αντιπολίτευσης διατυπώνει και τους υπαινιγμούς ότι πιθανότατα έχει «ανταλλάξει» την εκλογή μουφτή στη Θράκη που θέλει ο Ερντογάν (σήμερα ο μουφτής ορίζεται από την πολιτεία) με την απελευθέρωση των δύο ελλήνων στρατιωτικών. Η ελληνική κυβέρνηση διά στόματος Αλέξη Τσίπρα έχει κάνει αναφορές για την ανάγκη συζήτησης με τους πολίτες μουσουλμανικής πίστης σε σχέση με τον μουφτή και τον τρόπο επιλογής του. Ωστόσο υπογραμμίζει ότι το θέμα δεν έχει σχέση με τα ελληνοτουρκικά αλλά αφορά τις υποχρεώσεις του ελληνικού κράτους έναντι των πολιτών του. Ως εκ τούτου δεν μπορεί να αποτελέσει αντικείμενο διπλωματικής διαπραγμάτευσης. Στελέχη που γνωρίζουν άλλωστε τις σκέψεις που υπάρχουν στο εσωτερικό της κυβέρνησης, σημειώνουν τη μεταρρυθμιστική προσπάθεια που έχει ξεκινήσει με τη νομοθέτηση για την προαιρετική ισχύ της σαρίας, η οποία στηρίχθηκε από μεγάλη πλειοψηφία στη Βουλή, καθώς υπερψηφίστηκε και από τη ΝΔ.

Η επιμονή πάντως του Ερντογάν για εκλογή του μουφτή και ειδικά οι αναφορές του σε τούρκους δημοσιογράφους ότι το έθεσε στον Αλέξη Τσίπρα στη συνάντηση που είχαν στις Βρυξέλλες, καθώς και η αισιοδοξία του, τροφοδότησαν τα σενάρια περί ανταλλαγής. Κατά την επιστροφή του στην Αγκυρα, ο τούρκος πρόεδρος είχε υποστηρίξει σε σχέση με τη συνάντηση: «Συζητήσαμε και το θέμα της Δυτικής Θράκης… Αν θέλει ο Θεός, θα γίνει το θέμα του εκλεγμένου μουφτή. Μας λέει (ο Τσίπρας) θα περάσουμε νέο σύστημα, θα καταργήσουμε τον διορισμό του μουφτή».